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Plotting the transcript structure of a gene

Plotting the transcript structure of a gene. Sometimes, we need to display the different transcript structures of a gene. And this R script is designed for quickly accomplishing this task. First, we
2025-01-12
R

2025-01-20 晚东湖骑行

2025-01-20晚 东湖骑行. . 我经常晚上下班后,会去东湖绿道骑行一圈,大约30公里。 这是我很轻松的时候,周围的风景也很好。 快过年了,路灯上挂了红色中国结。 . 万家灯火。 蒙着薄雾,隐约中的房间,看起来像我想象中的太空城,以前读三体的时候,经常未来的世界是什么样的? . 晚上10点,这一条长廊很安静。 . 每一次晚上骑行路过这里,都会拍一张这棵夜空下的小树。 . 一棵掉光了
2025-01-22
生活

Homologous gene conversion across different species

Homologous gene conversion across different species. Here, we use three mouse genes as an example. The method is the same for more genes. 12345678library(homologene)genelist<-c("Acadm",&
2025-01-24
Bioinformatic

2025-01-27 休假

2025-01-27 休假. 27开始休假了,早上起来洗了衣服,中午去绿道骑行一圈。 这次的路线还是绕汤菱湖,到白马州,再经落雁景区到后湖,然后回学校,大概38公里。 . 从水生所门出,经过医学部到梨园,阳光很好。 . 靠近武汉站附近的白马州,这条直道,每次我过都拍一张,很幽静。 . 经过落雁景区,停留1分钟拍了张照片。 . 落雁岛,这次我才看清真的有大雁在岛上落栖,好多大雁。 . 路过刘
2025-01-28
生活

2025-02-01 寒假在家

2025-02-01 寒假在家. 1月27日晚上回去,2月1日早上回到武汉,在姐姐家过的年。 . 1月28日中午才到家,刚好赶上团圆饭。 相比于学校食堂的饭菜,家里简直是天堂,尤其最爱湖南的油豆腐片,炒什么都很好吃,连鸡肉都比菜市场买的要香很多,还有芹菜牛肉很下饭。 . 29日,大年初一,吃过午饭后,去旁边的一个公园玩,里面有一个废弃的火车站。前面是诺诺和我爸,北方的冬天,外边很冷,但多数时候是
2025-02-01
生活

Adjusting extremely small p-values in a volcano plot

Adjusting extremely small p-values in a volcano plot. When creating a volcano plot for differential gene expression, a few points (genes) with extremely small or even zero p-values can cause the Y-axi
2025-02-02
R

2024年总结

2024年总结. 2024年,才刚刚过去,对于我来说,却已经有一些模糊了。粗粗回顾一下,并没有太多事情很需要被记住,就好像一瓢子舀上来的汤汤水水一样,都是稀的,泛善可陈。 硬要说干货的话,也许SXL的课题有了一个大致的轮廓算是一个进步吧,有毕业的希望了。我记得至少在2023年底的时候,我对自己啥时候能答辩是不抱有期望的,所以,我心里是感激的,感激这一年命运的眷顾和自己的付出。至少能看到进展了,尽管
2025-02-04
生活

读《病隙碎笔》史铁生

读《病隙碎笔》史铁生. 已经快十一点了,整个晚上我都处于一种浮躁而略带焦虑的空虚中,几乎难以沉下心来工作,于是就翻了一会儿史铁生的《病隙碎笔》。 我很感激史铁生和他的书,在我即将或者已经情绪崩溃的时候,他的一些句子常常可以让我安静下来。我感佩他的智慧,也有一点同情他的不幸,正是因为他的故事,让我觉得我已经拥有很多,不能再贪心了。 你想不到的,一个残废了腿,还得了尿毒症的人,留下的话和描述的故事,
2025-02-08
读书

Fold enrichment of diff TE genes in chromosome

Fold enrichment of diff TE genes in Chr. I need to ceate a plot which showing the enrichment fold of TE genes compared to genome annoted genes on each chomosome of drosophila. . the calculation method
2025-02-11
R

Proportional-area Venn diagram

drawing a proportional area Venn diagram in R. Sometimes, when creating a Venn diagram, we need the size of each area to be proportional to the values it represents. In this case, we require a proport
2025-02-19
R
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