两组基因数据Overlap显著性怎么算？Fisher检验与超几何分布详解

两组基因数据Overlap显著性怎么算？Fisher检验与超几何分布详解

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下面的韦恩图展示的是两种处理条件下的差异基因overlap情况。

图中的 p值（p-value） 代表的是统计学显著性，具体来说，它衡量的是：“这两个基因列表之间的重叠（交集），是否只是由于随机偶然造成的。”

这个p值是怎么算出来的？

这种韦恩图的重叠显著性通常使用超几何分布（Hypergeometric Distribution）或Fisher精确检验（Fisher’s Exact Test）来计算。